Por associar os modais rodoviário e ferroviário, pelo Porto Seco de Anápolis podem ser transportados os mais diversificados tipos de cargas, interligando todo o mercado do Centro-Oeste a outros pontos do País, inclusive portos e aeroportos, transformando grandes distâncias em distâncias economicamente competitivas. O terminal funciona tanto como origem quanto destino de cargas nacionais, importadas ou destinadas à exportação.

O Porto Seco Centro Oeste é privilegiado por oferecer em seu terminal, o modal de transporte ferroviário. Trata-se de uma operação em parceria com a VLI (Vale Logística Integrada), que tem viabilizado o trânsito ferroviário de forma eficiente, segura e econômica para a recepção e o escoamento de mercadorias nacionais e de mercado externo.

A antiga Rede Ferroviária Federal (RFFSA), hoje Ferrovia Centro Atlântica (FCA), ganhou dimensões extremamente vantajosas com a instalação do Porto Seco Centro Oeste S/A, a partir de 1999, ampliando o crescimento socioeconômico de Anápolis e região. 

Essencialmente dinâmica, a FCA, hoje, é uma das mais importantes ferrovias do País, com um volume de movimentações consideráveis de cargas conteinerizadas, sendo o Porto de Anápolis o principal terminal abastecedor desse modal. Com 7.080 quilômetros de extensão, é considerada o principal e mais eficiente eixo de conexão entre as regiões Nordeste, Sudeste e Centro-Oeste do Brasil. Atravessa mais de 250 municípios brasileiros em sete estados: Minas Gerais, Espírito Santo, Rio de Janeiro, Bahia, Sergipe, Goiás e São Paulo, além do Distrito Federal. Sua integração a grandes portos como os de Vitória (TVV, Paul, Codesa), Santos, Angraporto (Angra dos Reis – RJ), Terminal de Aratu; Porto de Salvador (BA), Porto de Anápolis – GO e Uberlândia – MG e sua conexão a outras ferrovias, como a Estrada de Ferro Vitória/Minas (EFVM), MRS Logística, Companhia Ferroviária do Nordeste (CFN) e Brasil Ferrovias, fazem da FCA um grande corredor de importação e exportação do País.